Податковий Кодекс: документ дає право на застосування вирахування з ПДВ. Але тепер дозволено не виписувати його, якщо одержувач не є платником ПДВ - однак при цьому повинна бути дотримана письмова форма згоди обох сторін з даним фактом. 
Для покупця - платника ПДВ необхідно, щоб продавець оформив рахунок-фактуру, так як на підставі саме цього документа він отримує право на застосування вирахування з цього податку. При цьому оформлення рахунку-фактури не є підтвердженням факту передачі товарів або послуг - для цих цілей служить виключно товарна накладна або акт прийому-передачі робіт (послуг, майнових прав). Сам же рахунок-фактура, в рамках бухгалтерського та податкового законодавства, не визнається первинним документом, оскільки не володіє всіма ознаками такого.
 
За допомогою даного документа Ви можите вести облік виданих організації рахунків-фактур. Документ не впливає на складські запаси товарів (розхід товарів зі складу виконується за допомогою Видаткової накладної).
Потрібно вибрати банківський рахунок вашої організації та Контрагента, якому видається рахунок-фактура. Так само заповнити вантажоодержувача, поле "До платіжно-розрахунковому документу" і Ставку ПДВ (в Документах) з (Номенклатури, Контрагента, Констант) - це значення впливає на ставку ПДВ в документі. Кнопка 'Обробити' дає зрозуміти, що документ виконав свою місію і тепер відзначений як обработанности (Архівний).

 
А також заповнити специфікацію накладної.
Кнопки для редагування специфікації:
- додавання товару в специфікацію;
- редагування позиції специфікації;
- видалення позиції специфікації.
У разі, якщо документ створюється на підставі видаткових накладних, можна ввести номер цього документа у відповідне поле (при створенні на підставі документа це поле заповнюється автоматично).
Після заповнення специфікації, документ можна зберегти, натиснувши кнопку "Записати", або відразу Обробити, натиснувши кнопку "Обробити" (після обробки редагування документа блокується і його зміна можлива тільки після відміни обробки). Кнопка "Закрити" закриває форму документа.
Роздрукувати документ можна, тільки після зберігання або обробки, натиснувши кнопку "Друк".
Специфікація Рахунок-Фактури

 
У вікні редагування специфікації Рахунока-Фактури необхідно заповнити наступні поля:
   - Номенклатура (товару) - натиснути на кнопку і вибрати з довідника номенклатури (там же можна ввести і нову номенклатуру товару),
   Рахунок-Фактура:
   - Кількість - товару,
   - Одиниця виміру (товару) - одиниця виміру встановлена номенклатурі за замовчуванням присвоюється даному полю, зберігається в документі і при зміні даного значення в номенклатурі, не призведе до зміни в документі,
   - Ціна - це ціна, за якою товар відпускається покупцеві, але в поточній валюті (це та валюта яка виставлена в константах і курс обов'язково (1, 1)) і обчислюється так: (Ціна у валюті)*Курс/Кратність,
   - Ціна у валюті - це ціна, за якою товар відпускається покупцеві в валюті, валюта може бути як поточна, так і будь-яка інша,
   - Ставка ПДВ - ставка ПДВ вибраной Вами номенклатури товару, зберігається в документі і при зміні даного значення в номенклатурі, не призведе до зміни в документі,
   - Валюта - валюта ціни одиниці обраної Вами номенклатури товару, в дужках вказано курс, зберігається в документі і при зміні даного значення в номенклатурі, не призведе до зміни в документі
   - Номер ВМД - номер вантажної митної декларації на товар.
   - Країна - країна походження товару.